Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms