Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms