Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms