Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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