Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms