Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ufl1Q8CCJ3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms