Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms