Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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