Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtpaQ8BWP5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms