Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cxcl16Q8BSU2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cxcl16Q8BSU2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cxcl16Q8BSU2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Cxcl16Q8BSU2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Cxcl16Q8BSU2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Cxcl16Q8BSU2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cxcl16Q8BSU2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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