Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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