Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Actr5Q80US4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Actr5Q80US4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms