Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms