Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GcsamQ6RFH4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms