Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q6DFW0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms