Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctnna3Q65CL1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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