Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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