Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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