Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm29266-201ENSMUST00000190392 600 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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VcanQ62059 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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VcanQ62059 Gm21734-201ENSMUST00000190346 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm21902-201ENSMUST00000190361 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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VcanQ62059 Gm21752-201ENSMUST00000191023 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm28841-201ENSMUST00000191284 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm21813-201ENSMUST00000191291 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm21878-201ENSMUST00000191365 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm21855-201ENSMUST00000191596 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm20833-201ENSMUST00000192708 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm21907-201ENSMUST00000192989 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm20928-201ENSMUST00000192992 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm20851-201ENSMUST00000193038 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm37476-201ENSMUST00000193046 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm21678-201ENSMUST00000193567 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VcanQ62059 Gm21768-201ENSMUST00000194103 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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