Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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