Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms