Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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BB287469Q3UT53 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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BB287469Q3UT53 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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BB287469Q3UT53 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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BB287469Q3UT53 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BB287469Q3UT53 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BB287469Q3UT53 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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