Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms