Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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