Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trappc13Q3TIR1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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