Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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