Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms