Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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