Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps8Q0P5W1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms