Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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