Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Siah2Q06986 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms