Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp2Q06649 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Sh3bp2Q06649 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms