Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr5Q04683 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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