Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms