Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cacna1sQ02789 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cacna1sQ02789 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms