Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms