Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top2aQ01320 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms