Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms