Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms