Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SmsP97355 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms