Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tubg1P83887 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms