Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gbx1P82976 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms