Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms