Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cldn18P56857 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cldn18P56857 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cldn18P56857 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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