Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lbx1P52955 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lbx1P52955 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lbx1P52955 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lbx1P52955 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lbx1P52955 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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