Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2e3P52483 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms