Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VdrP48281 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms