Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrprbP47758 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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