Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syt1P46096 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syt1P46096 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms