Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sftpa1P35242 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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